Das Unterstützungssystem der GBA-Spiele findet sich auch in FE9 wieder, allerdings mit einigen Änderungen. Unter anderem sind einige alte Affinitäten herausgefallen und einige neue hinzugekommen, und die Werteboni, die sie einem einbringen, wurden im Vergleich zu den Vorgängern stark reduziert. Weiterhin gilt jedoch, dass zwei Einheiten, die eine Unterstützung miteinander aufgebaut haben und nicht weiter als drei Felder voneinander entfernt stehen, abhängig von ihren Affinitäten Boni auf ihre Kampfwerte erhalten.

Die Boni der Affinitäten beider Charaktere werden zusammengerechnet und danach gegebenenfalls abgerundet.

Feuer	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	+0,5	-	+2,5	-
Stufe B	+1,0	-	+5,0	-
Stufe A	+1,5	-	+7,5	-
Dunkelheit	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	+0,5	-	-	+2,5
Stufe B	+1,0	-	-	+5,0
Stufe A	+1,5	-	-	+7,5
Licht	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	-	+0,5	+2,5	-
Stufe B	-	+1,0	+5,0	-
Stufe A	-	+1,5	+7,5	-
Donner	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	-	+0,5	-	+2,5
Stufe B	-	+1,0	-	+5,0
Stufe A	-	+1,5	-	+7,5
Wind	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	-	-	+2,5	+2,5
Stufe B	-	-	+5,0	+5,0
Stufe A	-	-	+7,5	+7,5
Wasser	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	+0,5	+0,5	-	-
Stufe B	+1,0	+1,0	-	-
Stufe A	+1,5	+1,5	-	-
Himmel	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	-	-	+5	-
Stufe B	-	-	+10	-
Stufe A	-	-	+15	-
Erde	Ang.	Vert.	Trf.	Aw.
Stufe C	-	-	-	+5
Stufe B	-	-	-	+10
Stufe A	-	-	-	+15

Ang. und Vert. gelten hierbei sowohl physisch als auch magisch.

Zwei Beispiele zur Veranschaulichung:
Ike und Soren haben eine Unterstützung auf Stufe A miteinander. Solange sie innerhalb eines drei-Felder-Radius zueinander stehen, erhalten beide jeweils +1 Ang. und +22 Aw.

Titania und Alja haben eine Unterstützung auf Stufe A miteinander, und beide haben zudem eine Unterstützung auf Stufe B mit Boyd. Wenn alle drei innerhalb von drei Feldern zueinander stehen, erhält...
...Titania insgesamt +2 Ang., +4 Vert. und +17 Trf.
...Alja insgesamt +3 Ang., +4 Vert. und +12 Trf.
...Boyd insgesamt +3 Ang., +2 Vert. und +15 Trf.