Fire Emblem Fates ist in 3 Editionen aufgeteilt. Jede Edition erzählt eine eigenständige Geschichte, hat andere Charaktere, Zugriff auf anderen Klassen und Items und auch einige Feature-Unterschiede.
Bis Kapitel 5 spielt sich das Spiel immer komplett gleich. Danach muss der Spieler entscheiden, an wessen Seite er kämpfen möchte.

Hoshido – die Familie, in der man geboren wurde
oder Nohr – die Familie, die einen großgezogen hat.

Die Version, die man sich gekauft hat, hat automatisch dessen Route mit dabei. Aber auch wenn man sich die Birthright-Version gekauft hat, hat man die Wahl zwischen Hoshido und Nohr. Eventuell muss das Spiel sich die Daten der andere Route aus dem Internet herunterladen -  dies kostet einmalig 20€, also die Hälfte des Kaufpreises des Spiels.

Es gibt eine dritte Edition, Revelation, in der man sich keine der beiden Familien anschließt. Diese Edition wird nur digital verfügbar sein – außer man gehört zu den glücklichen, die sich die limitierte Special Edition geholt hat, diese enthält nämlich alle 3 Editionen.

Egal, für welches Spiel man sich entscheidet, man bekommt in jedem Fall ein Spiel mit der Größe von Awakening. 2 Editionen verdoppeln den Inhalt nahezu – lediglich die ersten 5 Kapitel und einige Kampfschauplätze sind in beiden Edtionen gleich, zudem erlangt man durch Mehrspielerfunktionen an Items und Klassen aus der anderen Edition.